Objetivou-se descrever as percepções dos agricultores familiares de uma cooperativa agropecuária do Rio Grande do Sul sobre as implicações causadas pela mudança de sistema produtivo: da agricultura convencional para a produção agroecológica de alimentos. Para embasar o trabalho foram usadas as teorias da mudança, agroecologia, cooperativismo e agricultura familiar. O estudo classifica-se como uma pesquisa exploratória e descritiva, com tratamento qualitativo dos dados, por meio da análise de conteúdo. Foram realizadas entrevistas com os 39 agricultores. Observa-se que nas percepções individuais os assuntos mais referenciados foram: conhecimento, comunicação e planejamento; resistência e mudança; saúde e renda. O estudo demonstrou que a mudança de sistema produtivo é lenta, porém importante para os agricultores. Contudo, o comprometimento de todos na transição agroecológica foi essencial para o bom desempenho organizacional.