Este trabalho apresenta uma introdução aos principais métodos usados em cálculos de modelagem molecular aplicados no planejamento de compostos bioativos. É feita uma descrição introdutória dos métodos das duas aproximações usadas predominantemente em estudos de modelagem molecular: a aproximação clássica, que inclui os métodos da mecânica molecular e da dinâmica molecular, e a aproximação quântica, que inclui os métodos ab initio e semi-empÃricos. É discutido como estes métodos podem ser aplicados para determinação da estrutura molecular e de propriedades decorrentes destes compostos e qual a melhor escolha de acordo com o problema a ser abordado.
